Wiki Bundle Checklist

Korean post는 독자가 들어오는 입구이고, wiki note는 반복해서 참조할 지식 단위입니다. 그래서 post를 먼저 길게 쓰기보다, 아래 bundle이 어느 정도 갖춰졌는지 확인한 뒤 글로 승격합니다.

Minimum Bundle

PartRequired notePass when
Reader questionBlog writing guide글이 한 문장 질문에 답한다
RouteCoverage matrix중심축이 AI, Computational Biology, Math, Papers, Projects, Infra, Agents 중 하나로 정해진다
ObjectEntities or Computational biology entities무엇을 모델링하는지 명확하다
RepresentationRepresentation contractraw object가 token, graph, coordinate, embedding, sample로 바뀌는 과정이 보인다
MethodAIarchitecture, learning method, generative model, evaluation 중 무엇이 핵심인지 분리된다
FormulaFormula intake필요한 수식과 모든 symbol이 설명된다
EvidenceClaim-evidence boundarybenchmark, split, metric, baseline, leakage, uncertainty의 경계가 있다
Paper sourcePaper review workflow특정 논문 claim은 paper note나 evidence table로 분리된다
ExtractionPaper to wiki extractionpaper claim이 object, method, formula, evidence update로 나뉜다
Public boundaryPublishing gateprivate server, account, port, path, collaborator, unpublished result가 없다
Next pathPost promotion gate독자가 다음에 볼 3-7개 note가 있다

Post Type Bundles

Post typeBundle에 포함할 것
AI architecture maparchitecture note, input modality, complexity, inductive bias, evaluation risk
Learning method explainerobjective, data signal, representation, transfer setting, failure mode
Generative model explainermodeled distribution, sampling path, objective, evaluation metric, validity checks
Computational biology object postentity note, representation contract, label context, split unit, leakage risk
Docking or SBDD postprotein-ligand object, pose/scoring concept, preparation boundary, benchmark/evaluation note
Protein or sequence postsequence/structure object, representation, family split, task output, evidence boundary
Math-heavy postformula pattern, symbol table, operation meaning, objective-metric link, example use
Paper cluster postindividual paper notes, claim-evidence table, benchmark card, updated concept notes
Project postproject note, problem definition, design decision, verification, public artifact boundary
Infra postpublic runbook, failure taxonomy, reproducibility note, no operational secrets
Agent workflow postworkflow note, tool/memory boundary, verification loop, handoff protocol

Formula Rule

Equation이 topic을 더 이해하기 쉽게 만든다면 포함합니다. Post에서는 equation을 짧게 둘 수 있지만 core operation을 숨기면 안 됩니다.

예를 들어 attention을 Attn(x)로만 줄이면 부족합니다. Post 수준에서 유용한 형태는 아래와 같습니다.

그 다음 , , , , , softmax가 적용되는 axis를 정의합니다. 더 긴 derivation은 Formula intake 또는 관련 Math note에 둡니다.

When To Create Wiki Notes First

아래 경우에는 post를 쓰기 전에 wiki note를 먼저 만들거나 업데이트합니다.

  • post가 같은 term을 한 paragraph 이상 정의해야 할 때.
  • claim이 symbol table이 없는 formula에 의존할 때.
  • result가 dataset split, benchmark, leakage risk에 의존할 때.
  • topic이 AI, Computational Biology, Math를 가로지르지만 route page가 없을 때.
  • post의 핵심 주장을 만들기 위해 paper가 여러 개 필요할 때.
  • reader가 다음에 무엇을 읽어야 할지 알기 어려울 때.

Naming Rule

Sequence, structure, molecule, ligand, docking, conformer, genome-level object가 함께 나올 수 있으면 public umbrella로 Computational Biology를 씁니다. Molecular Modeling은 molecule, conformer, docking, structure-heavy subset에만 씁니다. Model family와 learning method는 AI, formula와 abstraction은 Math에 둡니다.