Computational Biology Research
Computational biology research는 biological object와 model behavior가 만나는 지점을 질문으로 정리합니다. 여기서는 구조기반 모델링, 단백질, 분자, 유전체 sequence 수준에서 공개 논문과 공개 benchmark로 검토할 수 있는 연구 방향을 둡니다.
질문은 object, split, metric, evidence plan이 함께 잡힐 때 구체화합니다. 단순히 모델 이름이나 데이터셋 이름을 모으는 대신, 어떤 생물학적 대상에서 어떤 claim을 검증할지 먼저 정합니다.
Questions
| 주제 | 질문 | 연결 |
|---|---|---|
| Pose-aware molecular generation | molecular generation이 docking/pose validity를 실제로 개선하는가? | Structure-based modeling, Generative Models |
| Pocket-ligand representation alignment | protein pocket, ligand conformer, interaction feature를 같은 representation space에서 정렬할 수 있는가? | Entities, Learning Methods, Architectures |
Scope
- 공개 dataset, paper, benchmark로 설명 가능한 질문만 둡니다.
- 공개 문맥만으로 이해되지 않는 세부 정보는 넣지 않습니다.
- 구현물이나 pipeline이 중심이 되면 Projects로 넘깁니다.
- 아직 검증하지 않은 성능, novelty, applicability claim은 쓰지 않습니다.